Kluczowa różnica: Autoodtwarzanie analizuje nowo wykryte nośniki wymienne i urządzenia oraz uruchamia odpowiednią aplikację do odtwarzania lub wyświetlania zawartości. Autorun wykrywa plik autorun.if na nośniku i wykonuje instrukcje zgodnie z plikiem.

Natrafiamy na terminy "autoodtwarzanie" i "autorun" często, gdy mamy do czynienia z komputerami, a wielu ludzi, którzy nie znają się na technologiach, często mylą te dwa. Chociaż te słowa są do siebie podobne, różnią się one funkcją. Działają one również inaczej, w zależności od typu systemu operacyjnego, z którego użytkownik korzysta obecnie.

Autoodtwarzanie to nowsza funkcja w porównaniu z autouruchamianiem i została wprowadzona w systemie Windows XP. Według witryny systemu Windows głównym zadaniem autoodtwarzania jest zbadanie "nowo odkrytych nośników wymiennych i urządzeń oraz, w oparciu o treści takie jak zdjęcia, pliki muzyczne lub wideo, uruchamia odpowiednią aplikację do odtwarzania lub wyświetlania zawartości." Uruchamia także okno dialogowe, które wymaga uprawnień użytkownika, aby móc uruchomić i z którym programem. Autorun został uruchomiony z powrotem w Windows 95 i został użyty, aby ułatwić instalowanie aplikacji. Gdy użytkownik włożył płytę CD do systemu, który miał plik autorun.inf w katalogu głównym, system Windows automatycznie wykryje dysk CD i zacznie działać i pobierać aplikację. Jest to najczęściej spotykane na płytach CD systemu.

Autoodtwarzanie i automatyczne uruchamianie działają inaczej w przypadku różnych systemów operacyjnych. Na przykład dysk CD, na którym znajduje się system Windows XP, działa inaczej w porównaniu z tą samą płytą CD umieszczoną w systemie Windows 7. W prawie wszystkich wersjach funkcja autouruchamiania jest często wykonywana przed autoodtwarzaniem, chyba że autouruchamianie jest wyłączone. W Windows XP, jeśli autorun wykryje plik Autorun, obejdzie Autoodtwarzanie i bezpośrednio wykona plik oraz jego wskazówki. W systemie Windows 7 Autorun nie może ominąć autoodtwarzania, nawet jeśli Autorun wykryje plik Autorun, musi otworzyć okno wyświetlania i poprosić użytkownika o pozwolenie na wykonanie pliku.

Funkcja autouruchamiania ułatwiała instalatorom nietechnicznym umieszczanie płyty CD na tacy CD; jednak to również obniża bezpieczeństwo komputerów. Na przykład: jeśli płyta CD uruchomiona w systemie ma wirusa, a także plik autorun, system uruchomi plik i załaduje wirusa do systemu. W przypadku gry automatycznej poprosi użytkownika o pozwolenie na załadowanie jednego lub więcej plików z płyty CD. Autoodtwarzanie było bardziej rozwinięte w przypadku plików muzycznych, wideo i zdjęć. System ten wyposażony jest w system obsługi, który może obsługiwać lub wyświetlać ten rodzaj mediów.